Палатата в Благоевград има подписани споразумения за партньорство с Търговско-промишлени палати в Солун, Драма, Серес, Пиерия и Кавала, с Палатата на търговията, индустрията и навигацията – Хихон, Испания, Работната група на икономическите камари по дължината на границите на страните кандидатки за присъединяване към ЕС - АРГЕ 28, Еврорегион "Стримон - Струма" и др.

На регионално ниво Палатата поддържа добри партньорски отношения с местните органи за самоуправление, държавната администрация, университети и професионални училища, както и с други организации в неправителствения сектор.

Със свои представители Търговско-промишлена палата - Благоевград участва в работата на Областния съвет за развитие, Регионален съвет за тристранно сътрудничество, Регионален съвет за безопасни условия на труд и др.